Fullmäktige utgör Skaos högsta beslutande organ och sammanträder två gånger per år. I Skao löper den demokratiska tråden från kyrkovalet, via valda representanter, till sammansättningen av organisationens styrelse. Arbetsgivarkonferenserna, som är namnet på de organ som väljer ledamöter till Skaos fullmäktige, har genomförts under våren 2026. Fullmäktige väljer i sin tur Skaos styrelse.